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Comment nous savons que cela a commencé à Wuhan

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J'ai revu les preuves du propagation précoce du virus en 2019 et les premiers cas confirmés et je suis arrivé à ce que je pense être le cours des événements le plus probable pour la façon dont le virus est apparu.

Pour faire court, il semble que le virus se soit propagé à l'échelle mondiale dans la seconde moitié de novembre 2019. Ce qui était difficile à comprendre, c'est pourquoi, si c'était dans des pays du monde entier cet hiver-là, l'explosif les épidémies n'ont commencé qu'en février et mars 2020.

En examinant à nouveau en détail les rapports sur l'émergence du virus, il semble que cela soit dû au fait que le parcours du virus, de la première émergence à l'automne 2019 aux flambées explosives au début de 2020, s'est produit de manière plus lente et plus échelonnée que ce à quoi on pourrait s'attendre d'un compréhension simple des virus. Ce n'est pas parce que le virus n'était pas présent dans les pays avant d'y provoquer des épidémies explosives – c'est l'hypothèse simpliste qui est contredite par les données – mais parce que le virus ne provoque pas toujours des épidémies explosives lorsqu'il est présent.

Le nouveau virus de type SRAS semble avoir commencé à infecter les humains vers la fin octobre 2019. C'était très probablement à Wuhan. On pourrait suggérer que si le virus se propageait dans le monde en novembre 2019, il aurait pu commencer n'importe où et le fait qu'il ait été détecté pour la première fois à Wuhan n'implique rien sur son lieu de départ.

Cependant, il semble que l'épidémie de décembre à Wuhan, où elle a été détectée pour la première fois, ait été la plus importante à cette date. De plus, le mois suivant, Wuhan a été le premier endroit à connaître une épidémie explosive qui a taxé les services de santé, quelques semaines avant n'importe où ailleurs. Le fait qu'il était en avance sur la courbe de ces épidémies plus importantes est un indicateur fort que le virus était là depuis le plus longtemps et qu'il y est apparu à l'origine.

Moléculaire horloge études, qui analysent la constitution génétique des premiers cas pour calculer quand leur ancêtre commun le plus récent était là, ont tendance à mettre l'émergence du virus fin octobre ou début novembre, ce qui est cohérent avec la propagation mondiale vers la fin novembre. 

En Chine, un fuite d'un rapport du gouvernement sur les premiers cas à Wuhan a identifié neuf patients hospitalisés en novembre 2019 avec ce qui a ensuite été confirmé comme COVID-19 (la première date d'apparition des symptômes était le 17 novembre), bien qu'ils n'aient jamais été ajoutés au total officiel. UN étude a également affirmé n'avoir trouvé aucun anticorps neutralisant chez les donneurs de sang de Wuhan de septembre à décembre 2019, bien que sa fiabilité ne soit pas claire.

Au Brésil, échantillons d'eaux usées en banque est devenu positif le 27 novembre 2019, indiquant une importante propagation communautaire du SRAS-CoV-2 à la fin du mois. De façon intéressante, échantillons d'Italie dans une étude distincte n'est devenu positif que le 18 décembre. Aucun positif d'eaux usées n'est apparu plus tôt que cela nulle part (à l'exception d'un positif anormal pour Barcelone en mars 2019 qui est largement considéré comme un faux positifs).

Test des eaux usées à Florianópolis, Brésil pour l'ARN du SRAS-CoV-2

En Angleterre, L'étude REACT de l'Impériale a testé environ 150,000 2021 personnes pour les anticorps au début de XNUMX et a demandé à ceux qui avaient été testés positifs quand ils se souvenaient d'avoir des symptômes. Il en est résulté le graphique suivant. 

Une augmentation notable des maladies symptomatiques peut être observée à partir de la fin novembre 2019 jusqu'à un niveau stable qui se poursuit tout au long de l'hiver. Le déclenchement explosif de la première vague fin février 2020 est également bien visible. Ce graphique illustre parfaitement comment le virus peut circuler pendant des mois à un faible niveau (trois mois dans ce cas), y compris pendant la saison de la grippe hivernale, avant qu'une épidémie explosive ne se produise, apparemment à l'improviste.

Nous n'avons pas de bonnes données des États-Unis sur la propagation précoce, car le pays a systématiquement omis d'entreprendre des études sur des échantillons stockés d'eaux usées ou sur des individus, à l'exception d'un Étude des anticorps de la Croix-Rouge qui a trouvé des anticorps à la mi-décembre 2019 mais n'a pas examiné les échantillons précédents ni confirmé par des tests d'ARN viral.

Néanmoins, il n'y a pas eu de pénurie de reportages en provenance des États-Unis qui ont raconté les histoires de plusieurs personnes qui sont tombées malades d'une maladie de type Covid en novembre 2019 et ont ensuite été testées positives pour les anticorps Covid (alors qu'elles n'avaient pas été malades entre-temps) .

Ces personnes comprennent Michel Melham du New Jersey, qui déclare avoir été infecté avec plusieurs autres lors d'une conférence autour du 21 novembre 2019 ; Uf Tukel, qui déclare avoir été infecté en Floride avec 10 autres personnes fin novembre 2019 ; Stephen Taylor et sa femme, infectés au Texas en novembre 2019 ; et Jim Rouille, infecté au Nebraska le même mois. Bill Rice, Jr. a rassemblés les reportages médiatiques sur ces premiers cas américains confirmés par des anticorps. Il est à noter qu'aucun d'entre eux ne prétend avoir été infecté avant novembre.

Cette preuve de propagation fin novembre en Chine, au Brésil, en Angleterre et en Amérique est, je pense, très convaincante ; même si un ou deux des cas s'avèrent erronés, je ne pense pas qu'il soit probable que tous le seront. Ils sont également cohérents avec les estimations des études d'horloge moléculaire susmentionnées.

Ces preuves suggèrent que le virus ne se propageait pas dans le monde beaucoup plus tôt que cela. Ceci est basé sur les résultats négatifs des études sur les eaux usées, les niveaux négligeables de l'étude impériale, le manque d'Américains signalant une maladie et l'absence de patients en Chine. Les études qui semblent montrer une propagation mondiale plus précoce que cela peuvent être dues à une réaction croisée des anticorps ou à une contamination des tests PCR à fort grossissement.

Cela nous permet de conclure que le virus se propageait à un faible niveau dans le monde fin novembre 2019, mais probablement pas beaucoup plus tôt que cela. Que s'est-il passé ensuite ?

L'épidémie sur le marché de Huanan semble avoir commencé vers le 1er décembre - c'était la première date d'apparition des symptômes dans le premier groupe de patients Covid confirmés, qui a commencé à être admis à l'hôpital le 16 décembre. Cette éclosion semble avoir été beaucoup plus importante que les autres éclosions jusqu'à ce point. Au 2 janvier, 41 patients avaient été confirmé comme admis à l'hôpital avec un test Covid positif accompagné d'une pneumonie et d'un scanner thoracique caractéristique; six d'entre eux sont morts plus tard.

C'est ce groupe d'hospitalisations qui a conduit à la détection du virus, comme au moins neuf échantillons de ces patients ont été envoyés par des cliniciens pour analyse génomique entre le 24 et le 31 décembre 2019. La détection du virus lors de l'épidémie de marché humide semble donc avoir été une conséquence directe de la gravité de cette épidémie - elle a causé beaucoup plus d'hospitalisations que d'autres épidémies jusque-là et a incité un certain nombre de cliniciens à envoyer indépendamment des échantillons pour identification. Il était donc pratiquement inévitable qu'il soit détecté lors de cette épidémie.

Cela dit, l'épidémie était très faible par rapport à la plupart des vagues que nous avons vues depuis 2020, et même par rapport à ce qui s'est passé en Chine le mois suivant. L'examen de la courbe des décès de Covid signalés pour la Chine en 2020 indique que l'épidémie explosive dans la région n'a vraiment commencé que les premiers jours de janvier (en comptant environ 20 jours).

Cela peut expliquer pourquoi il y avait initialement incertitudes savoir s'il y avait une transmission interhumaine, alors que le 14 janvier, il devenait de plus en plus évident qu'il y avait comme ils étaient au milieu d'une poussée explosive pour la première fois. C'est aussi probablement la reconnaissance de cette flambée explosive qui a poussé les autorités chinoises à imposer des restrictions à Wuhan à partir du 23 janvier.

Curieusement, l'épidémie explosive de janvier dans la province du Hubei ne s'est pas reproduite dans d'autres parties de la Chine, qui n'ont pas été troublées par le virus à ce stade. Au lieu de cela, le prochain endroit pour voir une épidémie explosive était South Korea, plus d'un mois plus tard en février, et une fois de plus, il était étrangement limité en grande partie à une ville, Daegu. C'était à une échelle similaire à l'épidémie de Wuhan avec un nombre similaire de décès.

Ce fut ensuite au tour de Italie et l'Iran connaîtront des épidémies explosives à partir de la mi-février. L'épidémie en Italie était encore principalement limitée à une partie du pays, même si son ampleur dépassait tout ce qui avait été vu jusqu'à présent, et l'épidémie iranienne était d'une ampleur similaire. Puis ont suivi New York et le nord-est des États-Unis, ainsi que l'Angleterre, la France et une grande partie de l'Europe occidentale (mais pas l'Europe de l'Est ou une grande partie du reste des États-Unis). Toutes ces épidémies ont été beaucoup plus près à l'échelle italienne plus grande qu'à l'échelle chinoise et sud-coréenne. D'autres endroits ont continué avec une faible propagation jusqu'à ce qu'ils aient leurs premières vagues explosives plus tard en 2020, ou dans certains cas en 2021 ou même 2022.

Ce qui me frappe à ce sujet, c'est la façon dont la taille et la portée des épidémies ont augmenté progressivement entre novembre 2019 et février 2020. La propagation en novembre 2019 était mondiale mais de faible niveau. En décembre, l'épidémie du marché humide de Wuhan a fait monter les choses d'un cran, entraînant un nombre plus élevé d'hospitalisations et donc la détection du virus. Puis en janvier, Wuhan a connu la première épidémie explosive de Covid et une vague de décès. Et en février, les grandes vagues européennes et américaines ont commencé, augmentant encore l'échelle de plusieurs crans, là où elle est restée en grande partie. (Omicron, lorsqu'il est arrivé fin 2021, a encore augmenté la taille des épidémies, mais a considérablement réduit le taux de mortalité.)

Cela donne, je crois, une image précise de la façon dont le virus est apparu – via une évolution progressive vers des épidémies de plus en plus importantes à partir d'un début peu propice de faible propagation en novembre. Ce mouvement est, je présume, le résultat de modifications génétiques du virus, qui altèrent sa transmissibilité dans différentes populations et contextes - une hypothèse qui rejoint les conclusions de études d'horloge moléculaire.

Nous pouvons donc, je pense, être raisonnablement sûrs que le virus est apparu pour la première fois à Wuhan à l'automne 2019 et n'y a pas seulement été détecté pour la première fois, car Wuhan a été le premier à connaître les épidémies les plus importantes en décembre et en janvier, ce qui suggère que le virus avait été là le plus long.

Tiré à part de QuotidienSceptique



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