Ce qui suit est un extrait du chapitre 1 de Peur d'une planète microbienne: Comment une culture de sécurité germophobe nous rend moins en sécurité.
Lorsque ma sœur entre pour la première fois dans une chambre d’hôtel, elle emporte avec elle un contenant de lingettes désinfectantes et essuie toutes les surfaces qui auraient pu entrer en contact avec un être humain dans un passé récent. Elle ne fait rien d'autre avant que cela n'arrive. Pas de position assise, pas de déballage. Rien.
"Pourquoi fais-tu cela?" Je lui ai demandé.
"On ne sait jamais quoi ni qui était là-dedans", répondit-elle.
C'est vrai partout où vous allez, pensais-je, mais je n'ai pas insisté davantage sur ce point à ce moment-là. Ma sœur est germophobe et je savais qu'elle ne serait pas convaincue par tout ce que son petit frère pourrait dire, même si j'étais chercheur en maladies infectieuses. Mais peut-être que vous le ferez.
Les germophobes vivent dans le déni
Les germophobes (qui pourraient aussi être orthographiés germaphobes) vivent dans le déni car les microbes sont partout et ils ne peuvent être évités. Il existe environ 6 × 10 ^ 30 cellules bactériennes sur Terre à un moment donné. À tous égards, il s’agit d’une énorme quantité de biomasse, juste derrière les plantes, et dépassant de plus de 30 fois celle de tous les animaux. Les microbes représentent jusqu'à 90 pour cent de la biomasse de l'océan, avec 10^30 cellules, ce qui équivaut au poids de 240 milliards d'éléphants d'Afrique. L’air que vous respirez contient une quantité importante de particules organiques, notamment plus de 1,800 XNUMX espèces de bactéries et des centaines d’espèces de champignons en suspension dans l’air sous forme de spores et de fragments d’hyphes. Certains microbes peuvent rester dans l’air pendant des jours, voire des semaines, généralement en faisant du stop sur la poussière ou les particules de sol. La densité de l’air que nous respirons signifie que nous inhalons des milliers de particules microbiennes pour chaque heure passée à l’extérieur. Entrer à l'intérieur n'est pas très différent, car l'air intérieur est généralement associé à l'environnement extérieur immédiat, avec des différences dues à la ventilation et à l'occupation. Il est presque impossible de trouver un endroit, intérieur ou extérieur, complètement stérile, même si certains endroits sont plus sales que d'autres.
Si vous travaillez dans un sous-sol moisi et endommagé par l'eau sans respirateur de protection, le décapage des cloisons sèches moisies peut vous exposer très facilement à des centaines de millions de spores fongiques en aérosol, irritant votre gorge, vos sinus et vos poumons. Les feuilles que vous avez ratissées à l'automne, celles que vous avez ignorées pendant un certain temps jusqu'à ce qu'elles deviennent un désordre humide et brun jusqu'à ce que le temps devienne enfin sec et chaud, auraient pu libérer un nuage de bactéries et de champignons lorsque vous avez finalement commencé à ratisser ou à souffler. eux. Et plus tard, lorsque vous vous détendiez dans votre hamac, vous avez peut-être eu une petite toux. C'étaient vos poumons qui essayaient de se débarrasser de tous ces microbes que vous remuiez et inhaliez. Mais vous vous en êtes probablement remis. Les poumons sont assez efficaces pour éliminer la plupart des particules, même vivantes.
Plus tôt, en été, lorsque vous alliez nager dans un lac, vous étiez exposé à des milliards de microbes dès que vous touchiez l’eau. Les bactéries et autres organismes unicellulaires avaient déjà prospéré dans l’eau chaude et riche en nutriments à des niveaux astronomiques pour la saison estivale. Même si vous pensiez garder la bouche fermée, vous ne les avez pas complètement tenus à l'écart. Pas de problème, dites-vous, je vais juste nager dans les piscines et éviter tous ces germes. Pourtant, les piscines, même si elles contiennent des niveaux antimicrobiens de chlore, peuvent toujours contenir des matières fécales. E. coli et Pseudomonas aeruginosa. Ne me lance même pas sur la piscine pour enfants. Pensiez-vous que les couches de bain s'arrêtent souvent ? Um non. Les excréments et les microbes qui les accompagnent trouvent un moyen.
Toutes ces bactéries présentes dans le lac et la piscine ne vivent pas et ne se multiplient pas naturellement dans l’eau. Une quantité importante provient d'animaux, y compris d'humains. Nous hébergeons des milliards de bactéries sur notre peau, dans notre bouche et dans nos intestins. La piscine ne contient pas de microbes parce que les traitements chimiques n'ont pas fonctionné, elle contient des microbes parce que il y a des gens dedans. Nous sommes littéralement des usines à germes. C'est partout en nous, à l'intérieur de nous et sur tout ce que nous touchons.
Quand j'étais à l'université, une fraternité locale a organisé une collecte de fonds marathon dans les spas, au cours de laquelle les participants étaient parrainés pour rester assis dans des spas le plus longtemps possible. Certains l'ont fait pendant des heures. Au cours des jours suivants, beaucoup d’entre eux ont développé des éruptions cutanées avec des démangeaisons, des rougeurs et des bosses, avec des cloques autour des follicules pileux. Sans surprise, tout ce temps passé dans les spas les a transformés en grandes cultures de bouillon bactérien, inoculées par des gars de la fraternité et des filles de la sororité à proximité. L'eau chaude, même traitée chimiquement, ne pouvait pas supprimer la croissance pour toujours, et les bactéries, probablement celles qui colonisent la peau et provoquent des éruptions cutanées. Pseudomonas aeruginosa, a connu une croissance exponentielle. Il n’y a eu aucune contamination extérieure sinistre. La source de tout ça Pseudomonas, sans aucun doute, c’était le peuple lui-même.
Les humains en tant que bioréacteurs microbiens
Notre corps est colonisé par tellement de microbes que nos cellules (environ 10 100 milliards au total) sont dix fois plus nombreuses que nos habitants microbiens (environ 4.4 21,000 milliards au total). Le microbiote de notre corps est incroyablement diversifié, avec des milliers d’espèces de bactéries et de champignons qui expriment collectivement XNUMX millions de gènes, comparé à notre maigre génome de XNUMX XNUMX gènes. Comme l’a noté l’écrivaine scientifique et écologiste Alanna Collen dans son excellente introduction au microbiote humain 10% humain, génétiquement, nous ne sommes même pas 10 pour cent humains, c'est en fait plutôt 0.5 pour cent.
Quand et où trouvons-nous tous ces microbes ?
Pour quiconque a assisté à un accouchement naturel, il est évident que le bébé ne naît pas dans un environnement parfaitement propre. Tout d’abord, le vagin de la mère est chargé de bactéries, majoritairement du genre Lactobacilles. Vous pourriez reconnaître Lactobacillus de regarder la liste des ingrédients des produits à base de yaourt, car il s'agit souvent d'un composant majeur. C'est pourquoi certaines sages-femmes croustillantes conseillent aux femmes enceintes de se frotter le vagin avec du yaourt si elles pensent qu'elles pourraient contracter une infection à levures. Alors, les bébés sont exposés aux bactéries du yaourt ? Aucun problème avec cela! Mais ce n'est pas tout. Un autre phénomène courant : les femmes en travail peuvent déféquer. En raison de la pression intense dans le bas-ventre et le bassin, une femme en travail commence souvent à perdre le contrôle et peut parfois tout pousser. Par conséquent, le bébé peut être exposé aux bactéries fécales de la mère en plus des bactéries vaginales. Si cette exposition ne se produit pas à la naissance, elle pourrait également se produire plus tard à l'hôpital ou à la maison, car les bactéries fécales sont facilement aérosolisées/aéroportées et inhalées ou avalées. Quoi qu’il en soit, tout bébé en bonne santé finira par être colonisé par E. coli, Bacteroides, Clostridium, Staphylococcuset Streptocoque espèces, pour n’en nommer que quelques-unes. Si une mère allaite, le bébé sera également exposé à des lactobacilles et des bifidobactéries supplémentaires.
Une fois qu’un bébé commence à manger des aliments solides, son microbiote intestinal s’adapte aux nouvelles sources de fibres, de sucres, de protéines et de graisses avec une diversité accrue et un microbiome plus « adulte ». Le microbiome adulte est moins dynamique que celui du nourrisson au cours de la première année de vie, mais il peut encore être perturbé par des changements dans le régime alimentaire, l’état de santé général, l’exposition aux antibiotiques ou une infection. J'aborderai plus en détail au chapitre 2 la manière dont ces changements peuvent perturber les microbiotes et comment ils peuvent être associés aux problèmes de santé modernes. Mais même avec ces perturbations, les gens regorgent de microbes et sont quotidiennement exposés à un grand nombre de microbes supplémentaires à la maison, à l’école, au bureau ou à peu près partout ailleurs sur Terre.
La maison est l’endroit où se trouvent les germes
Lorsque la technologie de séquençage a également été utilisée pour déterminer la diversité microbienne dans l’air et la poussière des maisons et des bureaux, les résultats ont été fascinants. Les microbes intérieurs peuvent se trouver sur les surfaces ou dans l’air sous forme de bioaérosols. Il n’est pas surprenant que la principale source de microbes et de bioaérosols intérieurs soit l’environnement extérieur local. Cependant, les bioaérosols proviennent également des occupants animaux et humains, en raison de la respiration, de l'excrétion de cellules cutanées ou de l'utilisation des toilettes. Les particules présentes sur les surfaces peuvent être remises en suspension dans l'air sous forme de bioaérosols en marchant, en passant l'aspirateur, en nettoyant et même en dormant, car votre lit est plein de cellules mortes de la peau, de champignons et de bactéries.
Dans toute maison ou bâtiment occupé par des humains, les espèces de bactéries colonisatrices humaines sont abondantes. En fait, il est possible de prédire si une maison est occupée principalement par des hommes ou des femmes grâce à leur profil microbien, car des pourcentages plus élevés d'hommes étaient associés à une plus grande abondance de bactéries. Corynebacterium, Dermabactérieet Roseburie espèces, alors que les femelles étaient associées à une augmentation Lactobacillus espèces. Le fait qu'une famille ait un chat ou un chien pourrait également être déterminé par le séquençage de l'ARNr 16S. Les chiens apportent une plus grande diversité de bactéries, avec 56 types de bactéries différents contre 24 chez les chats. Au moins, les chats se nettoient eux-mêmes et passent beaucoup moins de temps à se renifler l'arrière-train, alors cela explique peut-être la différence.
Ce qui est encore plus impressionnant, c’est qu’à mesure que le microbiote d’un plus grand nombre d’individus était séquencé, il est devenu évident que chaque individu possède une colonie unique de microbes, aussi unique qu’une empreinte digitale. Bien que plus ou moins stables à l’âge adulte, ces microbiomes distincts peuvent être modifiés par des facteurs tels que l’alimentation, l’âge et les hormones. De plus, les individus génétiquement apparentés et cohabitants ont également tendance à avoir des cohabitants microbiens plus similaires. Une étude a déterminé que lorsqu’une famille quittait la maison, ses microbes persistaient pendant quelques jours, diminuant progressivement jusqu’à atteindre des niveaux indétectables. Cette perte d’empreintes microbiennes pourrait être utilisée à l’avenir par les médecins légistes pour aider à recréer une chronologie du moment où un suspect a quitté sa maison ou sa cachette.
Sans surprise, la salle de bain est le meilleur endroit d’une maison ou d’un bâtiment pour rencontrer des microbes sur les surfaces ou dans l’air. Dans une salle de bain, quelque chose d'aussi simple qu'une chasse d'eau peut générer des bioaérosols contenant des milliards de bactéries, certaines restant en suspension dans l'air pendant des heures, suffisamment longtemps pour se propager sur toutes les surfaces à proximité. Fermer le couvercle peut réduire le panache bactérien, mais pas autant qu’on pourrait le penser. Même des rinçages répétés ne peuvent pas éliminer complètement la génération de bioaérosols chargés de bactéries fécales. Par conséquent, lorsque vous entrez dans les toilettes, vous allez inhaler des bactéries et tout ce que vous touchez en sera recouvert. Cela n’augure rien de bon pour votre brosse à dents. Pourtant, d’une manière ou d’une autre, vous êtes toujours en vie.
Outre les expositions microbiennes que nous recevons de notre mère et de notre environnement immédiat pendant et après la naissance, les sources les plus importantes de microbes qui colonisent nos intestins sont déterminées par la nourriture que nous mangeons. Chez les nouveau-nés allaités, le lait maternel est à la fois une source de bactéries et un aliment que ces bactéries adoreront. Certaines bactéries présentes dans le lait maternel peuvent provenir de l’intestin et sont transportées vers les glandes mammaires par les cellules immunitaires en circulation, en plus des microbes qui colonisent la peau autour de l’aréole.
De plus, lorsque le bébé boit du lait directement au sein, certaines bactéries buccales rejoignent également les microbes associés au lait lors de leur voyage vers l'intestin. Les types de bactéries ainsi transférées sont déterminés par le régime alimentaire de la mère et le mode d'alimentation (par exemple directement par le sein ou indirectement par l'expression du lait maternel). Le microbiome du nourrisson change lorsque des aliments solides sont introduits, jusqu’à ce qu’il commence à ressembler à un microbiome adulte plus ou moins stable vers l’âge de 2 ans et demi. Les résultats de nombreuses études ont montré que les étapes du début de la vie sont les plus critiques pour le développement des microbiomes adultes.
Deux heures et cinq secondes avant la catastrophe gastro-intestinale
Nous connaissons tous des personnes obsédées par l’idée de garder leur nourriture « propre ». Jeter toute nourriture qui reste sur une table plus longtemps que le temps nécessaire pour manger un repas ou tout ce qui tombe sur le sol est devenu une pratique assez courante dans le premier monde. Il existe peu d’heuristiques ou de règles de raccourci qui sont devenues populaires, comme la « règle des deux heures » pour laisser de la nourriture de côté et la « règle des cinq secondes » pour manger des aliments qui ont touché le sol. À mon avis, la règle des cinq secondes est la plus avantageuse pour aider les parents à se sentir moins coupables lorsque leurs tout-petits jettent par terre de la nourriture parfaitement bonne depuis leur chaise haute. Mon tout-petit n’en a rien à foutre de l’hygiène alimentaire, alors pourquoi devrais-je le faire ? Il en va de même pour la règle des deux heures : parfois, nous sommes occupés et oublions que le chili était sur la cuisinière froide toute la soirée. Cela signifie-t-il que c'est toujours OK si nous le réchauffons ? Comment pouvait-on survivre avant la réfrigération ?
Si vous êtes un scientifique ou un microbiologiste en matière de sécurité alimentaire, votre travail consiste à identifier les dangers potentiels liés au stockage et à la préparation des aliments qui pourraient entraîner une contamination et des maladies. Il s’agit principalement de la production et de la préparation alimentaire industrielle et commerciale. Il est clair pour quiconque inspecte les restaurants qu’ils disposent d’une grande variété de procédures et que certaines d’entre elles sont meilleures que d’autres. Un jour, un inspecteur local m'a dit quels restaurants elle évitait (cela ne m'a pas arrêté, car j'aime trop l'un de ces endroits). Dans son cas, comme dans celui des microbiologistes alimentaires, même le risque de contamination est problématique. Le risque relatif, c'est-à-dire la probabilité que certaines pratiques conduisent à une contamination et à des maladies, est bien moins préoccupant. Ainsi, le moindre risque peut être considéré comme une violation. En d’autres termes, le moindre risque que les inspecteurs aient l’air de ne pas faire leur travail pourrait être un problème pour eux.
Au fil des années, cette philosophie du risque zéro concernant la préparation et le stockage des aliments s’est imposée dans les foyers. La règle des deux heures en est un bon exemple. La plupart des gens n’attendraient même pas aussi longtemps pour jeter de la nourriture. Pourtant, une grande partie des inquiétudes suscitées par la croissance d’agents pathogènes dans les aliments laissés de côté pendant deux heures sont le résultat de certaines hypothèses majeures. Cela inclut l'hypothèse que vous commencez avec une colonie viable d'un ou plusieurs microbes pathogènes, que l'aliment contient de faibles quantités de sel et de conservateurs, un pH neutre et qu'il se trouve à des températures optimales supérieures à 80 degrés Fahrenheit (~ 27°C). . Le cas classique d'intoxication alimentaire utilisé dans les cours de microbiologie est celui de grand-mère qui prépare une salade de pommes de terre pour le pique-nique d'été, utilise ses mains pour la mélanger et lui inocule ainsi un produit colonisant la peau. Staphylococcus aureus. Ensuite, il reste sur la table de pique-nique tout l'après-midi (bien plus de deux heures), et BAM, tout le monde est victime d'une intoxication alimentaire. C'est certainement un bon moyen d'augmenter les risques d'épidémie familiale, mais c'est la tempête parfaite, et beaucoup de choses ont dû se produire dans ce scénario pour rendre tout le monde malade.
La contamination croisée peut être un problème, surtout si vous préparez quelque chose qui sera consommé cru au même endroit où vous venez de découper du poulet. Même être propre avec du poulet a ses limites : le CDC met en garde contre le laver avant de le cuire, de peur de créer un tas de gouttelettes chargées de bactéries autour de votre évier. En réalité, la plupart des aliments raisonnablement cuits sont assez sûrs, et quatre heures est un délai raisonnable pour laisser de côté la plupart des aliments à température ambiante. Comme pour tout, les gens se portent généralement bien s’ils font preuve de bon sens et nettoient les dégâts qu’ils font dans la cuisine.
Le bon sens fonctionne également pour évaluer la règle des cinq secondes. La règle des cinq secondes stipule que si vous ramassez de la nourriture avant cinq secondes au sol, vous pouvez manger. Certaines études et reportages médiatiques ont en fait pris cela au sérieux afin de souligner que les bactéries adhèrent effectivement à vos aliments, quelle que soit la durée de leur séjour sur le sol. Mais à quel point est-ce utile ? Vous mangerez des bactéries lorsque vos aliments toucheront tout ce qui est entré en contact avec une surface non stérile. Plus important encore, quelles sont les chances que la bactérie présente sur cet aliment soit une souche pathogène de bactérie ou de virus ou qu’elle délivre une dose suffisante pour provoquer une maladie ?
Comme je l’ai mentionné plus tôt, les microbes présents dans un environnement intérieur imitent plus ou moins ceux de l’environnement extérieur ainsi que les microbiomes de ses habitants. Il est donc probable que vous avaliez ou inhaliez déjà une grande partie de ces bactéries. Bien sûr, si vous utilisez ce morceau de nourriture tombé sur le sol pour préparer une salade de pommes de terre, puis que vous le laissez à une température de 100 degrés toute la journée, ce n'est peut-être pas la meilleure idée. Ou, si vous avez coupé du poulet la veille et refusé de nettoyer tous les jus qui tombaient sur le sol, vous pourriez recevoir une plus grande dose de poulet. Campylobacter jejuni or Entéridite à Salmonella que ce avec quoi votre corps sera à l'aise. Sinon, les chances que vous mourriez ou même que vous tombiez malade en mangeant de la nourriture tombée sur le sol sont assez faibles. Pas nul, mais plus proche que la plupart des gens ne semblent le penser. Ne dis à personne que je te l'ai dit et ne laisse personne te voir le faire.
La théorie des mauvais germes
Le concept d’un microbiome « sain » n’existe que depuis quelques décennies, mais le concept de « germe mortel qui veut nous tuer » existe depuis bien plus longtemps. En raison de ce déséquilibre historique, nous consacrons encore beaucoup de temps aux microbes pathogènes et moins de temps à la manière dont notre environnement microbien normal pourrait empêcher l’entrée des insectes gênants. Comme je l’ai expliqué, la technologie utilisée par les scientifiques pour étudier l’écologie microbienne est relativement nouvelle. En revanche, la capacité d’isoler et de cultiver un seul micro-organisme pathogène existe depuis plus d’un siècle.
Le concept de maladie causée par des micro-organismes, connu sous le nom de théorie des germes, a dû vaincre plusieurs autres théories concurrentes. Certaines des théories les plus populaires étaient les théories des miasmes et de la saleté. La théorie des miasmes expliquait que les maladies étaient causées par des gaz nocifs présents dans l’atmosphère, libérés par la pourriture de la matière organique. La théorie très similaire de la saleté portait sur la contamination de l’eau et de l’air par les déchets humains. Bien que ces idées semblent primitives au regard des normes modernes, elles ont été défendues par de nombreux scientifiques traditionnels, même jusque dans les années 1930. Même certains termes que nous utilisons aujourd'hui trouvent leur origine dans ces théories, comme le paludisme, qui signifie essentiellement « mauvais air ».
Ce n'est qu'à la fin du 19th siècle que Robert Koch a présenté ses critères, aujourd'hui connus sous le nom de Les postulats de Koch, pour démontrer qu'une maladie est causée par un micro-organisme spécifique et filtrable. Comme la plupart des avancées scientifiques, Koch n’a pas développé ces idées à partir de zéro. D’autres pensaient dans le même sens. Mais il a réussi là où d’autres ont échoué en expliquant clairement comment reproduire son travail et l’appliquer à de nombreuses maladies infectieuses différentes. Les postulats de Koch stipulent que vous devez être capable d'isoler un organisme d'un individu infecté, de le cultiver en culture, de le réintroduire dans un animal sain, de réisoler et d'identifier le microbe comme étant identique à l'agent initialement isolé et suspecté. Il a formulé ces postulats sur la base de ses travaux sur le charbon et a en outre généré des données complémentaires sur la tuberculose et le choléra.
Bien que le travail effectué par Koch et d’autres pour isoler les bactéries pathogènes ait déclenché une explosion de l’identification des germes mortels, d’autres agents pathogènes comme les virus sont restés cachés et inconnus. Ils étaient trop petits pour être visualisés au microscope optique et ne pouvaient pas être cultivés sans cellules hôtes à infecter. On peut imaginer la frustration des scientifiques lorsqu'ils ont observé des maladies manifestement infectieuses, mais n'ont pas réussi à isoler l'organisme responsable. La grippe espagnole de 1918 en est un parfait exemple. De nombreux chercheurs étaient impatients d'appliquer les postulats de Koch pour découvrir l'agent infectieux présent dans les poumons des patients grippés. Pour compliquer les choses, les patients grippés gravement atteints développent souvent une pneumonie due à des infections bactériennes secondaires. En conséquence, on pensait initialement que ces organismes étaient responsables de la grippe. Plus important encore, le même microbe ne pouvait pas toujours être isolé des poumons des patients grippés. Le résultat fut un fouillis de preuves contradictoires, et au moment où un virus fut identifié comme l’agent causal de la grippe, la pandémie était terminée depuis longtemps. J'aborderai davantage la grippe et d'autres virus au chapitre 3.
Une fois que les chercheurs ont compris la théorie des germes sur les maladies, ils ont pu isoler de nombreux micro-organismes pathogènes et les réintroduire dans des animaux de laboratoire. Mais une chose s’est produite, c’est que les animaux ont tendance à résister à d’autres défis, en raison d’une réponse immunitaire active. En utilisant des animaux de laboratoire, les mécanismes de l’immunité acquise pourraient être étudiés et appliqués pour améliorer les soins aux patients grâce au développement d’antisérums et de vaccins qui protègent les personnes contre l’infection ou la réinfection. Et cela m'amène à mon sujet préféré !
Immunologie 101
J'ai quitté mon premier cours d'immunologie de premier cycle en 1994, sûr que j'allais devenir immunologiste. C'était il y a plus de vingt-cinq ans, et depuis lors, j'ai présenté le système immunitaire à de nombreuses autres personnes en tant qu'enseignant et mentor. La façon dont je l'ai souvent fait, en utilisant un exemple classique, ressemble à ceci : le scénario commence lorsque quelqu'un marche sur un ongle. Ma femme a marché sur un clou de tapis qui dépassait en 2009, alors que nous séjournions dans un hôtel loin d'être parfait lors d'une visite avec son père en Chine. Elle n'en était pas contente car elle craignait que l'ongle n'ait introduit la bactérie. Clostridium tetani dans les tissus mous de son pied. Si cela se produisait et que la bactérie survivait et se multipliait à des niveaux suffisants, elle produirait une vilaine toxine renforçant l’activité neuromusculaire appelée toxine tétanique qui provoquerait des contractions musculaires incontrôlables, le plus souvent présentées comme un tétanos.
Étant immunologiste, je lui ai demandé quelque chose comme : « Mais vous êtes vaccinée, n'est-ce pas ? Vous étiez dans le Peace Corps. Ils vous vaccinent pour tout. Elle a admis que c'était vrai. « Alors ne t'inquiète pas pour ça. Tout ira bien," dis-je avec confiance.
Je pouvais avoir confiance parce que je comprenais le concept de mémoire immunologique. Le système immunitaire est capable d'activer des cellules spécifiques à tous les agents pathogènes imaginables, et une fois l'infection éliminée, certaines de ces cellules restent comme des cellules mémoire, des cellules qui sont beaucoup plus rapidement et facilement activées lors d'une réinfection par le même ou un similaire. bogue. C’est tout le principe de la vaccination : nous essayons de tromper le système immunitaire en lui faisant croire que le corps a été infecté en utilisant des parties d’agents pathogènes ou un agent pathogène affaibli pour stimuler la même réaction et le développement de cellules mémoire spécifiques, sans risque d’infection primaire grave.
Si la réponse inflammatoire précoce n’empêche pas une infection, les cellules immunitaires résidant dans les tissus voisins, appelées macrophages, détecteront les problèmes. Ces cellules traînent dans nos tissus en attendant un signal de danger provenant d'une rencontre avec des bactéries comme C. tétanie. Une fois activés, les macrophages deviennent très habiles à la phagocytose (c'est-à-dire engloutissent et dégradent les germes dans des bulles intracellulaires appelées phagolysosomes) et sont capables de tuer de nombreux microbes envahisseurs et d'éliminer les cellules hôtes qui meurent à la suite de l'infection.
Dans certains cas, la réponse immunitaire précoce ne suffira pas à éliminer la petite mais importante quantité de C. tétanie ou la toxine qu’elle produit après qu’une personne marche sur un ongle. C'est à ce moment-là que la réponse immunitaire adaptative entre en jeu. Elle commence environ 4 jours après l'infection et culmine vers 10 jours environ. La réponse adaptative commence lorsque les cellules résidant dans les tissus, appelées cellules dendritiques (DC), sont activées avec les mêmes signaux qui activent d'autres cellules immunitaires innées. Comme les macrophages, les DC phagocytent et décomposent les agents pathogènes en leurs composants. Cependant, une fois activés, ils quittent le tissu infecté et migrent vers un ganglion lymphatique, où ils interagissent directement avec des cellules immunitaires adaptatives appelées cellules T.
Étant donné que les cellules T sont si diverses, seules quelques-unes sont activées au cours d’une infection donnée, et ces cellules activées se divisent frénétiquement pour produire des millions de clones d’elles-mêmes, se divisant toutes les 4 à 6 heures. Ils le font pendant plusieurs jours afin de générer un grand nombre de cellules identiques (c'est pourquoi une réponse immunitaire adaptative prend du temps à se mettre en place). De nombreuses cellules T ainsi activées quittent le ganglion lymphatique et migrent vers un site d’infection, en suivant des signaux chimiques, tout comme les autres cellules immunitaires.
Dans le même temps, certaines cellules T interagissent avec d’autres cellules du ganglion lymphatique appelées cellules B. Les cellules B proviennent de la moelle osseuse et peuvent reconnaître des parties de protéines situées à l'extérieur des récepteurs situés à leur surface. Les lymphocytes B sécrètent une forme soluble ou leur récepteur de surface que nous appelons anticorps. Les anticorps se lient aux agents pathogènes ou aux protéines et favorisent leur destruction, leur absorption et leur dégradation par les macrophages. Si un lymphocyte T reconnaît la même partie de l’agent pathogène, ou « antigène », alors le lymphocyte T fournit une « aide » au lymphocyte B afin que le lymphocyte B puisse produire des anticorps de liaison encore plus puissants. D’autres lymphocytes T peuvent tuer les cellules infectées, empêchant ainsi la propagation d’une infection. Grâce à ces processus, la réponse immunitaire adaptative génère une réponse hautement spécifique à l’agent pathogène, beaucoup plus ciblée, moins dommageable et plus régulée que la réponse inflammatoire innée précoce.
Finalement, à mesure que les microbes envahisseurs et les toxines qu’ils produisent sont éliminés par la réponse immunitaire adaptative, les cellules immunitaires situées sur le site de l’infection cessent de recevoir des signaux d’activation et commencent à recevoir des signaux « cesser et s’abstenir ». La plupart de ces cellules meurent et sont captées et dégradées par les macrophages qui nettoient les dégâts. Finalement, les tissus guérissent, les peaux mortes et les cellules musculaires sont remplacées et les choses reviennent à la normale.
Mais ce n’est pas tout ce qui se passe. Dans les ganglions lymphatiques et la rate, certaines cellules T activées deviennent des cellules mémoire. Les cellules mémoire peuvent être activées et se diviser beaucoup plus rapidement si jamais elles voient à nouveau le même antigène. De cette façon, nous gardons un souvenir de chaque infection que nous avons eue au cours de notre vie. Puisque les vaccins imitent cette réponse ; nous avons également un souvenir de chaque vaccination que nous avons reçue. Parfois, cette mémoire diminue un peu et nous devons recevoir une autre injection, sinon nous serions sensibles à une infection plus légère, mais l'aide que nous recevons des cellules mémoire lors d'une réinfection ou d'une vaccination de rappel est meilleure que de repartir de zéro. . Et c’est ainsi que le système immunitaire nous maintient en vie dans un monde rempli de bactéries, de champignons et de virus potentiellement mortels.
Si le système immunitaire est si efficace pour attaquer les bactéries, les champignons et les virus, pourquoi n’attaque-t-il pas toujours le nombre ridicule de microbes vivant autour de nous, sur nous et en nous ? Pourquoi notre système immunitaire n’explose-t-il pas à cause de tous les signaux de détection de microbes dans notre peau, nos poumons, notre bouche et nos intestins ?
Ce n’est pas le cas parce que le système immunitaire possède également une propriété appelée tolérance immunologique, dans lequel les mécanismes immunitaires sont supprimés afin d’éviter des dommages collatéraux inutiles. La tolérance immunitaire ne s’étend pas seulement à nos propres protéines, elle s’étend également à notre environnement microbien non menaçant. Les tissus qui sont constamment exposés aux microbes, comme notre intestin, sont chargés de cellules induisant une tolérance (appelées cellules T régulatrices) qui aident le système immunitaire à se contrôler et à prévenir les maladies auto-immunes.
Mais parfois, le système immunitaire ne tolère pas ce qu’il devrait être, et les gens contractent des maladies auto-immunes ou des allergies, ou réagissent de manière inappropriée à une infection. Il est intéressant de noter que l’incidence de ces conditions augmente partout dans le monde développé, car même si nous sommes entourés de microbes, nous sommes en fait de mieux en mieux « propres » que nous ne le pensons.
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